La saison 2006-2007 a marqué le retour de Manchester United au sommet sous la direction de Sir Alex Ferguson. Le club a remporté la Premier League, terminant six points devant Chelsea, avec Cristiano Ronaldo et Wayne Rooney menant une attaque fluide, soutenue par Paul Scholes et Ryan Giggs. En UEFA Champions League, United a atteint les demi-finales, produisant une victoire palpitante de 7-1 contre la Roma avant de tomber face à l'AC Milan. Ils ont également atteint la finale de la FA Cup, perdant 1-0 contre Chelsea après prolongation, et ont été éliminés au quatrième tour de la League Cup. La saison a démontré une brillance offensive et a marqué le début d'une autre ère de domination.
La saison 1999-2000 a vu Manchester United dominer le football anglais après son fameux triplé. Sous la houlette de Sir Alex Ferguson, ils ont raflé le titre de Premier League, terminant 18 points devant Arsenal, et marquant un record de 97 buts à l'époque. Dwight Yorke, Andy Cole, Teddy Sheringham, Ole Gunnar Solskjær et Ryan Giggs ont tous contribué, avec Roy Keane au milieu de terrain et David Beckham excellent sur l'aile droite. En Europe, United a atteint les quarts de finale de la Ligue des champions, s'inclinant face au Real Madrid. Ils ont été éliminés de la FA Cup au quatrième tour et se sont retirés controversément de la compétition pour participer au Championnat du monde des clubs de la FIFA. Sur le plan national, ils étaient inarrêtables.
La saison 2012-2013 fut une année marquante pour Manchester United, car elle a marqué la fin de l'ère Sir Alex Ferguson. United a remporté la Premier League avec 89 points, terminant avec 11 points d'avance sur son rival Manchester City. Robin van Persie, recruté d'Arsenal, fut la star, marquant 26 buts en championnat et remportant le Soulier d'or. En Ligue des champions de l'UEFA, United a été éliminé de manière controversée en huitièmes de finale par le Real Madrid. Ils ont également été éliminés en quarts de finale de la FA Cup par Chelsea et au quatrième tour de la Coupe de la Ligue par Chelsea. Ferguson a pris sa retraite à la fin de la saison, en champion.
La saison 1995-1996 fut un nouveau triomphe pour Manchester United sous la houlette de Sir Alex Ferguson. Malgré les critiques après les ventes de Paul Ince, Mark Hughes et Andrei Kanchelskis, la confiance de Ferguson dans la « Classe de 92 » — David Beckham, Paul Scholes, Nicky Butt et les frères Neville — a porté ses fruits. United a remporté la Premier League, remontant un déficit de 12 points pour devancer Newcastle United dans une course au titre palpitante, avec un Eric Cantona inspiré après son retour de suspension. Ils ont également remporté la FA Cup, battant Liverpool 1-0 en finale grâce à un but tardif de Cantona, réalisant ainsi un doublé coupe-championnat historique.
1992-1993 United a remporté la première édition de la Premier League, mettant fin à 26 ans sans titre de champion. L’arrivée d’Éric Cantona en novembre fut déterminante, son association avec Ryan Giggs, Mark Hughes et Paul Ince transformant l’équipe en champions.
1993-1994 United a de nouveau dominé, remportant la Premier League et la FA Cup, battant Chelsea 4-0 en finale pour son premier doublé Coupe-Championnat. Roy Keane a consolidé le milieu de terrain, et Cantona a continué d'être une source d'inspiration. Ils ont également atteint la finale de la Coupe de la Ligue mais ont perdu contre Aston Villa. Ces saisons ont cimenté la domination de Ferguson dans le football anglais.
La saison 1995-1996 fut un nouveau triomphe pour Manchester United sous la direction de Sir Alex Ferguson. Malgré les critiques après la vente de Paul Ince, Mark Hughes et Andrei Kanchelskis, la confiance de Ferguson dans la « Classe de 92 » — David Beckham, Paul Scholes, Nicky Butt et les frères Neville — a porté ses fruits. United a remporté la Premier League, rattrapant un déficit de 12 points pour devancer Newcastle United dans une course au titre palpitante, avec un Eric Cantona inspiré après son retour de suspension. Ils ont également remporté la FA Cup, battant Liverpool 1 à 0 en finale grâce à un but tardif de Cantona, réalisant ainsi un doublé coupe-championnat historique.
La saison 1991-1992 fut une année de transition mais cruciale pour Manchester United sous la houlette de Sir Alex Ferguson. United termina 2e de la First Division, manquant de peu le titre au profit de Leeds United après avoir mené une grande partie de la campagne. Ils remportèrent la Coupe de la Ligue, en battant Nottingham Forest 1 à 0 grâce à un but de Brian McClair, marquant le premier trophée majeur de Ferguson à United. En Europe, ils gagnèrent la Supercoupe de l’UEFA, en battant l’Étoile Rouge de Belgrade 1 à 0, tandis que leur parcours en Coupe d’Europe des vainqueurs de coupe s’arrêta au deuxième tour. Malgré la déception en championnat, la saison jeta les bases de la domination de United dans la nouvelle Premier League.
La saison 1998-1999 a été historique pour Manchester United, l'équipe de Sir Alex Ferguson ayant réalisé le triplé. Ils ont remporté la Premier League, devançant Arsenal dans une course au titre serrée, avec des buts de Dwight Yorke, Andy Cole et Roy Keane animant l'attaque. United a également remporté la FA Cup, battant Newcastle 2-0 en finale. Le couronnement de la saison a été la Ligue des champions de l'UEFA, où ils ont réalisé une remontée spectaculaire contre le Bayern Munich, marquant deux fois dans le temps additionnel pour l'emporter 2-1. Cette campagne a cimenté l'héritage de United comme l'une des plus grandes équipes de football, alliant compétence, résilience et détermination implacable.
La saison 2009-2010 fut une campagne solide mais sans trophée pour Manchester United sous la direction de Sir Alex Ferguson. L'équipe a terminé 2e de la Premier League, à 9 points de Chelsea, malgré le départ de Cristiano Ronaldo au Real Madrid et l'émergence de Wayne Rooney, Dimitar Berbatov et Michael Carrick. En Ligue des champions de l'UEFA, United a été éliminé en quarts de finale par le Bayern Munich. L'équipe a également été éliminée de la FA Cup au cinquième tour et de la Coupe de la Ligue au quatrième tour. La saison a été marquée par une période de transition et de remaniement de l'effectif, alors que Ferguson commençait à intégrer de jeunes talents pour maintenir la domination de United lors de la prochaine ère.
La saison 1996-1997 fut une autre campagne dominante pour Manchester United sous la direction de Sir Alex Ferguson. Ils conservèrent le titre de Premier League, terminant 7 points devant Newcastle United, avec Eric Cantona, Ryan Giggs et Andy Cole menant une attaque puissante. United atteignit également les demi-finales de la FA Cup, s'inclinant 1-0 face à Chelsea, et fut éliminé au quatrième tour de la League Cup par Leicester City. En Europe, leur campagne en Ligue des champions de l'UEFA s'acheva en quarts de finale, face au Borussia Dortmund. La saison renforça la suprématie nationale de United, mélangeant les stars expérimentées de Ferguson avec la "Class of '92" émergente, jetant les bases d'un succès durable jusqu'à la fin des années 1990.
La saison 2005-06 fut mitigée pour Manchester United sous la direction de Sir Alex Ferguson. Le club a terminé 2e de la Premier League, à 8 points de Chelsea, avec Wayne Rooney, Ruud van Nistelrooy et Cristiano Ronaldo s'affirmant comme des menaces offensives clés. En FA Cup, United a été éliminé en quarts de finale par Liverpool, tandis qu'en League Cup, ils ont été éliminés tôt. En Ligue des champions de l'UEFA, ils ont atteint les huitièmes de finale, perdant face à l'AC Milan. La saison a mis en lumière un potentiel offensif mais aussi des vulnérabilités défensives, signalant le besoin d'ajustements de l'effectif et d'un raffinement tactique avant les campagnes suivantes.
2002-03 Manchester United a terminé 3e de la Premier League, derrière Arsenal et Chelsea. Ruud van Nistelrooy a excellé en attaque, soutenu par Ryan Giggs et David Beckham, mais les incohérences défensives ont limité l'équipe. En FA Cup, ils ont atteint le sixième tour, tandis qu'en Coupe de la Ligue, ils ont été éliminés tôt. En Europe, United a atteint les quarts de finale de la Ligue des champions, s'inclinant face au Real Madrid.
2003-04 Manchester United a de nouveau terminé 3e du championnat, avec Van Nistelrooy marquant de nombreux buts, mais les blessures ont affecté des joueurs clés. Leur parcours en Ligue des champions s'est arrêté en huitièmes de finale, tandis que les campagnes en coupes nationales ont été décevantes. Ces saisons ont marqué une phase de transition après le triplé, faisant le lien avant les années Ronaldo/Tevez.
1986-1987 Sous la direction d'Alex Ferguson, à sa première saison en tant qu'entraîneur, United a terminé 11e de la Première Division, montrant une certaine inconstance alors que Ferguson commençait à reconstruire l'équipe. Ils ont atteint le sixième tour de la FA Cup, s'inclinant face à Leeds United, et ont été éliminés tôt de la Coupe de la Ligue. La saison a été transitoire, axée sur la refonte d'une équipe qui avait eu du mal les années précédentes.
1987-1988 United s'est légèrement amélioré, terminant 2e de la Première Division, à 9 points de Liverpool. Leur parcours en FA Cup s'est terminé au quatrième tour, et ils ont de nouveau été éliminés tôt de la Coupe de la Ligue. Le plan de reconstruction à long terme de Ferguson prenait forme, jetant les bases des succès futurs.